作者:姓陈的女青年 | 来源:互联网 | 2023-05-17 16:12
具体热图参数见此网站:https:www.jianshu.comp1c55ea64ff3f数据格式:基因芯片信息,GSM样本号,Case为探针编码R语言中双冒号的作用是?回答一:要
具体热图参数见此网站:https://www.jianshu.com/p/1c55ea64ff3f
数据格式:基因芯片信息,GSM样本号,Case为探针编码
rm(list = ls())
getwd()
#row.names=1 指定第一列为行名
a=read.csv("for_heatmap.csv",row.names = 1)
# 输入必须为矩阵
a<-as.matrix(a)
heatmap(a)
# 使用pheatmap来绘制热图
install.packages("pheatmap")
#使用双冒号作用来指定包
pheatmap::pheatmap(a)
R语言中双冒号的作用是?
回答一:要使用某个包里的函数,通常做法是先加载(library)包,再调用函数。最新加载的包的namespace会成为最新的enviroment,某些情况下可能影响函数的结果。而package name::functionname的用法,一是可以在需要用某个函数时临时直接加载包,不用事先library。另一点更重要的是尽可能减少library带来的附带作用,这一点在开发R包时影响较大。而这种写法的副作用,是会稍微慢上那么几毫秒,在需要反复循环使用一个函数时对效率有影响,其他时候除了写起来麻烦一点,基本没有显见的副作用。
回答二:我常用的就是当有多个包下有同一名字函数时,可以用::指定包
绘制热图