自由能亥姆霍兹自由能(Helmholtzfreeenergy)和吉布斯自由能(Gibbsfreeenergy)等概念；IC50/Ki/Kd与结合自由能ΔG关系

****热力学三定律
参考&＃xff1a;https://baike.baidu.com/item/%E7%83%AD%E5%8A%9B%E5%AD%A6%E4%B8%89%E5%A4%A7%E5%AE%9A%E5%BE%8B/10572632?fr&＃61;aladdin

热力学第一定律&＃xff1a;物体&＃xff08;系统&＃xff09;内能的增加等于物体吸收的热量和对物体所作的功的总和
U &＃61; Q &＃43; W (Q表示能力&＃xff0c;W表示功)热力学第二定律:
热力学系统中熵的改变定义为&＃xff1a;在一个可逆过程中&＃xff0c;输入热量相对于温度的变化率&＃xff0c;即:
S &＃61; Q/T (T为物质的热力学温度;Q为热传导过程中输入的热量。)在绝热过程中:
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在热力学定律中:第零定律给出了温度T的定义;第一定律给出了能量守恒的关系;第二定律给出了熵增原理;第三定律告诉人们绝对零度无法达到。


***焓与熵区别

1、焓指能量&＃xff0c;熵指混乱度。2、焓的物理意义是体系中热力学能再附加上PV这部分能量的一种能量。H&＃61;U&＃43;pV。熵的物理意义是体系的混乱程度&＃xff0c;定义式&＃xff1a;dS&＃61;dQ/T。3、从性质上来说,焓和熵都是状态函数,不过熵可以为零&＃xff08;当微观状态数为1&＃xff09;不可为负&＃xff08;显然组合数不能小于1&＃xff09;。


概念

1、自由能

参考&＃xff1a;https://www.bilibili.com/video/BV1y7411S7bH/

自由能是指在某一个热力学过程中&＃xff0c;系统减少的内能中可以转化为对外做功的部分&＃xff0c;它衡量的是&＃xff1a;在一个特定的热力学过程中&＃xff0c;系统可对外输出的“有用能量”。可分为亥姆霍兹自由能和吉布斯自由能

自由能变化&＃61;内能变化&＃43;熵能变化


额外&＃xff1a;

结合自由能(binding free energy):是指存在于配体与受体之间的相互作用

2、亥姆霍兹自由能(Helmholtz free energy)

自由能在在等温等容的过程中&＃xff1a;U是内能&＃xff0c;S是熵相关

3、吉布斯自由能(Gibbs free energy)

自由能在在等温等压的过程中&＃xff1a;H是焓&＃xff0c;S是熵相关
焓H &＃61; U &＃43; PV (U是内能&＃xff0c;所以焓与内能也相关)

结合自由能&＃xff08;或打分函数&＃xff0c;Binding Free Energy&＃xff09;可以用如下公式转换为对应的IC50或者Ki/Kd&＃xff1a;

ΔGbinding &＃61; RT·ln Kdissociated &＃61; RT·lnKd ≈ RT·lnIC50 &＃61; −RT·pIC50