在Linux中安装RMySQL时如何选择MySQL版本

我正在Docker容器中运行R应用程序，并想使用RMySQL库连接到MySQL 8数据库。我可以使用

终端命令从容器连接到数据库，而没有任何问题，但是当我在R脚本中调用mysql时，出现未知的SSL连接错误（见下文）。

由于我在终端命令以及R脚本中使用相同的SSL证书，因此它必须与RMySQL使用的MySQL版本有关。我也需要在容器中安装MySQL 5.7，因为其他一些R软件包不能以其他方式构建。但是，根据下面的线程，您可以指定安装RMySQL时要使用的MySQL版本的目录：

adding RMySQL package to R fails (on Windows)?

因此，我在dbConnect()中设置了$MYSQL_HOME并命名为/etc/R/Renviron.site。

显然，您还需要复制一些.lib和.dll文件以使其在Windows中工作，但是在Linux上哪里可以找到等效文件？

数据库处理程序脚本：

install.packages('RMySQL',type='source')

传递给#' @import DBI
#' @import RMySQL
connectToDatabase <- function(myproject.db_config) {
dbConfig <- read.properties(myproject.db_config)
print(dbConfig)
dbHandle <- dbConnect(
MySQL(),dbname = dbConfig$databaseName,host = dbConfig$host,port = as.integer(dbConfig$port),user = dbConfig$user,password = dbConfig$password
)
return(dbHandle)
}
命令的配置文件：

read.properties()

R中的错误消息：

  

connection_create（主机，用户名，密码，dbname，as.integer（端口）、：
   连接失败：SSL连接错误：错误号未知

我自己找到了解决方案。未在dbConnect()调用中应用SSL证书。它们需要在mysql.cnf文件中定义，并通过dbConnect()参数传递到default.file：

dbHandle <- dbConnect(
MySQL(),dbname = dbConfig$databaseName,host = dbConfig$host,port = as.integer(dbConfig$port),user = dbConfig$user,password = dbConfig$password,default.file = dbConfig$configFile
)


传递给read.properties()命令的配置文件：

host=domain.subdomain.de
port=3306
user=john.doe
password=mypassword
databaseName=my_db
cOnfigFile=/staging/config/mysql.cnf


mysql.cnf ：

[mysqld]
ssl-ca=/staging/mysql-ssl/ca.pem
ssl-cert=/staging/mysql-ssl/client-cert.pem
ssl-key=/staging/mysql-ssl/client-key.pem