R中的pheatmap如何获得集群

我正在使用带有大数据的pheatmap.我的目的是对行和列进行聚类并分析主要聚类.我上传数据表并按如下方式执行热图:

 library (pheatmap)
 data<-read.table ("example.txt", header = TRUE)
 pheatmap(data)

通过这个我获得了我的数据的热图.我的example.txt看起来像这样:

    a   b   c   d   e   f
a   1   0.1 0.9 0.5 0.65    0.9
b   0.1 1   0.39    0.83    0.47    0.63
c   0.9 0.39    1   0.42    0.56    0.84
d   0.5 0.83    0.42    1   0.95    0.43
e   0.65    0.47    0.56    0.95    1   0.14
f   0.9 0.63    0.84    0.43    0.14    1

可能这是一个非常愚蠢的问题,但无论如何我会发布它.运行pheatmap(数据)后,如何获取与集群对应的元素？我是否必须以某些特定方式保存结果并通过其他R包进行分析？

抓住结果pheatmap并使用cutree.要提取10个集群,例如,您可以:

library(pheatmap)
res <- pheatmap(mtcars)
mtcars.clust <- cbind(mtcars, 
                      cluster = cutree(res$tree_row, 
                                       k = 10))
head(mtcars.clust)
# mpg cyl disp  hp drat    wt  qsec vs am gear carb cluster
# Mazda RX4         21.0   6  160 110 3.90 2.620 16.46  0  1    4    4       1
# Mazda RX4 Wag     21.0   6  160 110 3.90 2.875 17.02  0  1    4    4       1
# Datsun 710        22.8   4  108  93 3.85 2.320 18.61  1  1    4    1       2
# Hornet 4 Drive    21.4   6  258 110 3.08 3.215 19.44  1  0    3    1       3
# Hornet Sportabout 18.7   8  360 175 3.15 3.440 17.02  0  0    3    2       4
# Valiant           18.1   6  225 105 2.76 3.460 20.22  1  0    3    1       3

看?pheatmap,?hclust并?cutree寻求帮助.