PytorchDataLoader内存泄漏RuntimeError:received0itemsofancdata

现象

内存占用随着训练过程逐渐增大&＃xff0c;最终Out of memory。即使将不再用到的变量及时删除并使用gc.collect()&＃xff0c;也无法解决。

解决方案

方案1&＃xff1a;Dataset 的成员变量避免使用Python原生数据格式

以下面的Dataset代码为例&＃xff0c;如果使用 self.data &＃61; [x for x in range(24000000)]&＃xff0c;即使用了List作为Dataset的成员变量&＃xff0c;当 num_worker>0 时就会导致前面的现象&＃xff0c;而改用numpy ndarray 包装一下就没问题了。另外&＃xff0c;参考资料3里面说用DataFrame也会有问题。

小结&＃xff1a;定义Dataset的成员变量时&＃xff0c;使用 numpy ndarray 代替 List 和 DataFrame.

from torch.utils.data import Dataset, DataLoader
import numpy as np
import torchclass DataIter(Dataset):def __init__(self):self.data &＃61; [x for x in range(24000000)] # 有内存溢出风险&＃xff01;&＃xff01;&＃xff01;# 改成下面这样可以避免&＃xff01;self.data &＃61; np.array([x for x in range(24000000)]) def __len__(self):return len(self.data)def __getitem__(self, idx):data &＃61; self.data[idx]data &＃61; np.array([data], dtype&＃61;np.int64)return torch.tensor(data)


方案2&＃xff1a;将 num_worker 设成 <总CPU物理核心数

# 总核数 &＃61; 物理CPU个数 X 每颗物理CPU的核数 # 查看物理CPU个数
cat /proc/cpuinfo| grep "physical id"| sort| uniq| wc -l# 查看每个物理CPU中core的个数(即核数)
cat /proc/cpuinfo| grep "cpu cores"| uniq


例如我的机器得到结果是 物理CPU个数 1 乘以 7个物理核/CPU&＃61;总7个物理核心&＃xff0c;所以需要将 num_worker 设得比7更小&＃xff0c;例如可以设为 5&＃xff08;设为5表示有5个子进程&＃xff0c;加上主进程&＃xff0c;整个训练的过程就启动了6个进程&＃xff09;.

方案3&＃xff1a;避免使用cycle和zip函数

之前参加了一些数据比赛&＃xff0c;其中有些baseline使用到了 cycle 来封装一层dataloader&＃xff0c;使其可以循环读取&＃xff0c;但是这会导致内存泄漏&＃xff0c;即使你解决了一个问题&＃xff0c;另一个问题又会冒出来&＃xff0c;我这里举几个会导致的错误&＃xff1a;

1、RuntimeError: received 0 items of ancdata

2、RuntimeError: DataLoader worker (pid 20655) is killed by signal: Killed

3、OSError: [Errno 12] Cannot allocate memory.

等等等等。总之&＃xff0c;避免使用cycle&＃xff01;万恶之源啊&＃xff01;

另外&＃xff0c;据说 zip 函数也会导致内存泄漏&＃xff0c;见 https://www.mmbyte.com/article/48441.html

方案4&＃xff1a;将num_worker设为0

如果前面的方案都不奏效&＃xff0c;而且2个一起用上也没用的话&＃xff0c;最后还可以考虑将num_worker设为0&＃xff0c;设为0表示只使用主进程进行加载数据。

参考资料

[1] https://discuss.pytorch.org/t/num-workers-in-dataloader-will-increase-memory-usage/28522/7
[2] https://github.com/pytorch/pytorch/issues/13246
[3] https://github.com/pytorch/pytorch/issues/5902