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Python工具在异构任务集群环境中的高效并行处理

本文探讨了在PBS集群环境中管理大量依赖任务的有效方法。虽然Ruffus是一个成熟的选择,但作者对探索其他如WaterCan等工具产生了兴趣,以更好地适应不同资源需求的任务。

在处理大规模依赖任务时,特别是在PBS集群环境中,寻找一个既高效又能灵活适应各种资源需求的解决方案至关重要。长期使用Ruffus的经验使我对其功能十分满意,然而,出于探索更多可能性的目的,我对Python生态中的其他工具,比如WaterCan,也产生了浓厚的兴趣。

WaterCan的吸引力在于它为任务调度提供了一种新颖的方法,但其默认假设所有任务的需求相同,这与实际情况有所偏差。在我的应用场景中,任务的资源需求差异显著,有的需要高达8GB的RAM,而有的仅需100MB;有的任务能充分利用所有可用处理器,而有的则是单线程操作。因此,我的目标是找到一种方法,能够快速构建和运行任务管道,同时支持基于依赖关系的‘更新’功能,并且具备合理的日志记录机制,帮助追踪仍需执行的任务。

对于上述需求,是否有人成功利用WaterCan或其他类似系统实现了有效的管理?

作为WaterCan的开发者,我可以提供一些见解。WaterCan确实在处理任务依赖方面表现出色,能够智能识别输入或中间步骤的变化,并据此调整任务的执行状态。不过,目前WaterCan尚不支持为特定任务指定多进程分配。在过去,面对需要多线程执行的任务时,我通常采取保守策略,即为所有任务分配最大可能的进程数,这虽然导致单线程任务过度占用资源,但由于主要计算任务多为多线程,这一策略总体上是可行的。


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手机用户2502939381
这个家伙很懒,什么也没留下!
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