NatureMicrobiology:人类肠道古菌基因组目录

在一项由Nature Microbiology发表的研究中，研究人员收集并分析了来自全球24个国家、农村和城市人群中的人类肠道样本，构建了一个包含1,167个非冗余古细菌基因组的数据库，其中608个为高质量基因组。该研究不仅发现了多个以前未描述的新分类群，包括3个属、15个种和52个株，还证明了史密氏甲烷诺杆菌分支可以分为两个独立物种，其中一个为新发现的“肠甲烷诺杆菌假丝酵母菌”。

通过分析28,581个蛋白质簇，研究团队发现这些模式与年龄组和生活方式等社会人口特征显著相关。此外，研究还表明古菌具有特定的基因组和功能适应性，能够携带复杂的病毒组。

这项研究极大地扩展了我们对人类肠道古细菌的理解，为未来探索其对人体健康的影响提供了宝贵的资源。研究表明，古菌在不同环境中的生态作用已经得到了广泛研究，但在人类微生物组中的作用仍知之甚少。特别是那些居住在人类胃肠道（GIT）中的古菌，其功能至今仍不明确。

自1990年以来，基于测序的方法极大地促进了我们对古细菌多样性的理解，使得古细菌的生命之树从最初的两个门扩展到超过20个门水平的分类群。尽管如此，古菌在人类微生物组中的作用仍然被忽视。例如，产甲烷古菌长期以来被认为是人类GIT的一部分，但最近的研究也在口腔、鼻子、肺组织、阴道和皮肤表面检测到了这些微生物。

未来的研究将重点扩大和更均匀地分布在不同来源、社会背景、年龄和性别以及健康状况的人类受试者群体，以进一步揭示人类GIT古生物及其病毒的遗传多样性。同时，需要更多的实验方法来深入理解古菌在人体内的作用，包括肥胖等慢性疾病的发展机制。