手把手教你使用GraphPadPrism和Excel绘制回归分析结果的森林图

在之前的内容中&＃xff0c;我们讲到通过展示森林图&＃xff0c;可以更加直观的将回归分析结果可视化。详见&＃xff1a;一文带你玩转森林图&＃xff01;

在本期内容中&＃xff0c;我们来实际操练一下&＃xff0c;介绍几款常用的软件&＃xff0c;教大家绘制出高质量的森林图。

下面我们以2016年发表在JACC杂志上的一篇文章《A Prospective Natural History Study of Coronary Atherosclerosis Using Fractional Flow Reserve》为例&＃xff0c;利用文章中的Table 3多因素回归分析的结果来绘制森林图。

GraphPad Prism——论文绘图必备

GraphPad Prism是一款专门为医学专业人士设计的绘图软件&＃xff0c;同时也兼顾统计分析的功能&＃xff0c;操作便捷&＃xff0c;可以帮助我们轻轻松松绘制出高质量的专业图形&＃xff0c;简直就是科研人员的福利。

下面我们以GraphPad Prism 7为例&＃xff0c;来介绍一下如何绘制回归分析结果的森林图。

1. 新建GraphPad Prism文件

在New Table & Graph下选择Column&＃xff0c;利用软件提供的Metanlysis(Forest)plot教程数据新建一个GraphPad Prism文件。

2. 录入数据

按照软件提供的教程数据模板&＃xff0c;录入对应的变量名称、HR值以及95% CI。

3. 点击Graphs下级目录中的Metanalysis&＃xff0c;即可发现软件已经自动生成了一个森林图雏形&＃xff0c;但是我们还需要对图形的一些细节进行进一步调整。

4. 调整坐标轴&＃xff1a;双击坐标轴&＃xff0c;进入Format Axes界面

4.1 首先&＃xff0c;在Frame and Origin选项卡中设置坐标轴的起点(即无效线的坐标点)&＃xff0c;图形的形状、大小、位置&＃xff0c;坐标轴的颜色、厚度等参数。

4.2 然后&＃xff0c;在X axis选项卡中设置X轴的参数&＃xff0c;主要包括刻度范围&＃xff0c;刻度方向、长度&＃xff0c;X轴的起点和增量等信息&＃xff0c;同时在Titles & Fonts选项卡中设置变量名称与Y轴的距离。

5. 调整图形元素&＃xff1a;双击图片&＃xff0c;进入Format Graph界面

5.1 首先&＃xff0c;在Appearance选项卡中设置图形各个元素的细节&＃xff0c;包括颜色、形状、大小、厚度等信息。

5.2 然后&＃xff0c;在Data Sets on Graph选项卡中调整变量名称的顺序。

此时再次点击Graphs下级目录中的Metanalysis&＃xff0c;发现经过调整后的森林图如下图所示&＃xff0c;已经基本符合要求了&＃xff0c;但总觉得少一些什么。

6. 插入数据文件

如果想在森林图中进一步添加HR值、95% CI及对应的P值&＃xff0c;可以在图形处单击右键&＃xff0c;选择Insert Object → Excel Object&＃xff0c;插入一个Excel文件&＃xff0c;录入对应的数值即可。最终生成的森林图如下所示&＃xff0c;就可以直接导出放在文章中了哈。

Excel——办公居家标配

Excel作为Office办公三件套的标配之一&＃xff0c;其处理数据和绘图的功能也是非常丰富的&＃xff0c;它的强大足够超乎你的想象。相信大家对Excel的操作已经很熟悉了&＃xff0c;那么怎样利用Excel绘制森林图呢&＃xff1f;

我们以Excel 2013为例&＃xff0c;虽然Excel里并没有直接提供绘制森林图的图形模板&＃xff0c;但我们可以另辟蹊径&＃xff0c;通过选择“插入→ 图表 → 所有图表 → 股价图 → 收盘图”来绘制森林图的雏形&＃xff0c;如下图所示。

(Excel中录入数据)

这是一个旋转了90°的森林图&＃xff0c;我们在上一期内容中也介绍了类似的森林图&＃xff0c;这种类似的图也经常能够在文献中看到&＃xff0c;例如2018年发表在Arterioscler Thromb Vasc Biol杂志(影响因子&＃xff1a;6.6)的一篇文章《High-Density Lipoprotein Cholesterol and Mortality Too Much of a Good Thing?》。

文中为了表达HDL-C水平与全因死亡之间的关联性(HR值)&＃xff0c;就采用了这种旋转了90°的森林图来表达分析结果&＃xff0c;是不是和上面用Excel做出来的森林图雏形很相似呢。根据这种绘图风格&＃xff0c;小咖深深怀疑这6.6分文章里的森林图就是用Excel搞定的。。。

下面&＃xff0c;在这个图形的基础上&＃xff0c;我们可以对图形的一些细节进行加工&＃xff0c;包括字体、颜色、坐标轴刻度、交叉点等等(此处省略……字)&＃xff0c;修改完之后再将图形旋转回来就OK了&＃xff0c;如下图所示。

操作过程好像听上去很简单&＃xff0c;不过大家可能更关心的是“此处省略……字”的这个部分&＃xff0c;到底怎样对图形的细节进行调整呢&＃xff1f;

没关系&＃xff0c;为了尽可能给大家提供方便&＃xff0c;小咖已经做好了一个Excel图表的模板(ForestPlot.crtx)&＃xff0c;安利给大家。可以把这个文件放在Excel默认的模板目录下面&＃xff0c;小咖电脑中的目录为

(C:甥敳獲AdministratorAppDataRoamingMicrosoftTemplatesCharts)&＃xff0c;大家可以根据自己电脑安装的目录进行寻找。

然后&＃xff0c;当我们再次打开Excel时&＃xff0c;选择“插入→ 图表 → 所有图表 → 模板”&＃xff0c;就可以看见添加进去的森林图模板了。有了这个模板&＃xff0c;大家就可以把自己的数据直接Copy进去就大功告成啦。

此外&＃xff0c;如果还是觉得上面的森林图显得有些单薄&＃xff0c;我们还可以将做好的森林图再插入到Excel的表格中&＃xff0c;把图形和数据进行结合&＃xff0c;使得看上去更加高大上哈。

参考文献&＃xff1a;

[1] J Am Coll Cardiol. 2016;68:2247-55

[2] Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2018; 38:669-72

(有需要GraphPad模板和Excel图表模板的伙伴&＃xff0c;可以电脑打开医咖会官网&＃xff0c;直接下载&＃xff1a;

https://www.mediecogroup.com/method_topic_article_detail/183/)

1. 一文带你玩转森林图&＃xff01;

2. SPSS详细操作&＃xff1a;生存资料的Cox回归分析

3. 50种SPSS教程、10种样本量计算教程...全部为你整理在这里&＃xff01;

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