引言:
在(一)中我们学习到了什么是‘network communites’(网络社区)及其目标函数Q的求取,接下来我们要说明的是,我们要通过怎样的算法来实现将你的网络分成若干个集群。
我们这里用到的把网络划分成若干个集群的算法就是louvain算法。
它有几个优势:
(1):louvain算法被广泛应用。
(2):它可以快速实现集群的划分。
(3):集群的结果很好。
(4):在实践中的表现很好。
首先,我们输入进一个原始网络,将其中的每一个节点看做是一个‘community’。
然后,对于其中任意一个节点,louvain算法将做以下两个步骤:
(1):假如选定节点i,对节点i的每一个邻居节点j计算出(下面详细步骤会说明这个计算)
(2): 把节点i移动到计算出最大的的邻居节点j当中,使节点i,j成为一个新的‘community’。
如下图:
Q的计算就是把节点i从集群D转移到集群C对网络Modularrity(Q函数在作者(一)中讲到的目标函数)的变化,其中可分成两个公式,一个是把节点i移除集群D中的Q变化,另一个是将节点i移到新的集群C中Q的变化。(因为这两个步骤相似,所以下文中只提到将节点i移到新的集群C中Q的变化的实现)。
如下图:
计算要𝜟𝑸 (𝒊 → 𝑪)首先我们要定义两个新的量
𝜮𝒊𝒏:就是在集群c内部的边有几条
𝜮𝒕𝒐𝒕:就是在集群c内部所有节点的边数
(具体形式如图中的黑粗边)
然后我们有如图中的公式:
ps:第一个恒等于号后面的函数是我们在(‘network communites’(一))中定义的对每个集群的的模块化程度(Modularity),而第二个等于号后面的式子是将前面的式子的展开,而第三个等于号后面用我们上面的定义替换。
以上第一步算出来了Q(C)接下来还需要定义两个量:
如图:
𝒌𝒊,𝒊𝒏:你要添加进集群C的节点i与集群c中节点的连接边的数量。
𝒌𝒊 :指节点i所有的边的数量
(具体形式如图中的黑粗边)
这样我们就可以得出如下图公式:
和是节点i插入集群C前后的模块化程度的变化,
Q(C)中我们上文已经得到
Q({i})是由目标函数Q定义而来,第一项因为把节点i作为一个小的‘community’其内部没有边,所以为0,第二项因为小‘community’内部只有i一个节点所以没有,只有.
Q(C+{i})中绿色框的位置是因为节点i的加入而导致集群c中的内部边𝜮𝒊𝒏和全部边𝜮𝒕𝒐𝒕的变化导致的变化
所以我们可以得到下图中第一个式子:
然后将第一个式子和第二个式子相加得到第三个式子。
最后将节点i对每个集群计算的结果进行比对,结果最大的就把节点i加入到那个集群中。
在(1)步骤中,我们已经把集群都展示出来了,在(2)步骤中,我们就把属于每一个集群的所有节点都融入到一个‘super node’(超级节点)(每一个集群一个)。
如下图是经过一轮louvain算法后的集群效果图: