从1979年起,类Unix系统就采用一种特别的——对某些人可能是晦涩难解——方法组织文件。现在,如果能克服种种潜在难题,Linux发行版Fedora项目计划改变储存二进制应用的文件系统层级结构。Red Hat开发者Harald Hoyer和Kay Sievers提议将所有的可执行文件移入/usr/bin目录,将它们的库根据需要移入/usr/lib或/usr/lib64。
systemd作者Lennart Poettering认为,将应用程序文件合并进/usr中,可以明显降低复杂性。不过,这种做法的缺点是它与文件系统层级结构标准Linux Standard Base相冲突。