如何修改npm依赖代码？

公司内部仓库有很多私有 npm 包。这些包能够使用，但经常需要更改其源码来 hotfix bug 或实现特殊需求。这时简单的方案有这几种：

1. 直接修改 node_modules 内源码。这在自动化部署时会产生问题（线上自动化构建时，拉取的是未经修改的依赖）。




2. fork 依赖 git 源码，修改后

   1

   npm link

   到业务项目中。这时原依赖的 git 仓库并不适合与业务项目做合并。




3. 通知依赖作者等待版本更新。这时一旦跨部门那么效率并不高。

请问哪种方式比较靠谱，或有什么更加合适的方案呢？